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pull-down、免疫沉淀、免疫共沉淀、染色質免疫共沉淀、EMSA有什么差別?

2019-4-5 13:31:57點擊:


pull-down實驗:其基本原理是將靶蛋白-GST融合蛋白親和固化在谷胱甘肽親和樹脂上,作為與目的蛋白親和的支撐物,充當一種“誘餌蛋白”,目的蛋白溶液過柱,可從中捕獲與之相互作用的“捕獲蛋白”(目的蛋白),洗脫結合物后通過SDS-PAGE電泳分析,從而證實兩種蛋白間的相互作用或篩選相應的目的蛋白,“誘餌蛋白”和“捕獲蛋白”均可通過細胞裂解物、純化的蛋白、表達系統以及體外轉錄翻譯系統等方法獲得。

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免疫沉淀:(immunoprecipitation)是指利用抗體可與抗原特異性結合的特性,將抗原(常為靶蛋白)從混合體系沉淀下來,初步分離靶蛋白的一種方法。 

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免疫共沉淀(co-immunoprecipitation):是一種在體外探測兩個蛋白分子間是否存在特異性相互作用的一種方法。其原理是如果兩個蛋白在體外體系能夠發生特異性相互作用的話,那么當用一種蛋白的抗體進行免疫沉淀時,另一個蛋白也會被同時沉淀下來。

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染色質免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation Assay, ChIP):ChIP是一項比較流行的研究轉錄因子(transcriptionfactor,TF)與啟動子(promoter)相互結合的實驗技術。它的基本原理是在活細胞狀態下固定蛋白質-DNA復合物,并通過超聲或酶處理將其隨機切斷為一定長度范圍內的染色質小片段,然后通過抗原抗體的特異性識別反應沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質與DNA相互作用的信息。它能真實、完整地反映結合在DNA序列上的調控蛋白,是目前確定與特定蛋白結合的基因組區域或確定與特定基因組區域結合的蛋白質的一種很好的方法。 


凝膠遷移實驗(EMSA):通常將純化的蛋白和細胞粗提液和32P同位素標記的DNA或RNA探針一同保溫,在非變性的聚丙烯凝膠電泳上,分離復合物和非結合的探針。DNA-復合物或RNA-復合物比非結合的探針移動得慢。同位素標記的探針依研究的結合蛋白的不同,可是雙鏈或者是單鏈。當檢測 如轉錄調控因子一類的DNA結合蛋白,可用純化蛋白,部分純化蛋白,或核細胞抽提液。在檢測RNA結合蛋白時,依據目的RNA結合蛋白的位置,可用純化或部分純化的蛋白,也可用核或胞質細胞抽提液。競爭實驗中采用含蛋白結合序列的DNA或RNA片段和寡核苷酸片段(特異), 和其它非相關的片段(非特異),來確定DNA或RNA結合蛋白的特異性。在競爭的特異和非特異片段的存在下,依據復合物的特點和強度來確定特異結合。


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